Ojciec Święty odwiedził nasze miasto 7 czerwca 1999 roku.Przejechał wówczas ulicami toruńskiej starówki i na specjalną własna prośbę wstąpił do katedry śś. Janów. Na ulicach starówki witały go tysięczne tłumy torunian i wiernych z całej diecezji.

Po południu w auli Uniwersytetu Mikołaja Kopernika Papież spotkał się z przedstawicielami nauki i rektorami wszystkich uczelni wyższych w Polsce.

Wieczorem odprawił na toruńskim lotnisku nabożeństwo czerwcowe, które zgromadziło 300 tysięcy wiernych. Podczas uroczystej celebry beatyfikował księdza Stefana Wincentego Frelichowskiego.

W trakcie wizyty Ojca Świętego w Toruniu, w Dworze Artusa trwała Krajowa Wystawa Filatelistyczna (4-12.06.1999r.).

W 20 rocznicę wizyty Jana Pawła II w Bydgoszczy i Toruniu zostały przygotowane wydawnictwa pocztowo – filatelistyczne.